Starfsemi stofnunarinnar skiptist á 4 deildir:
Deildarstjóri er Helgi S. Helgason, helgihe@hi.is
Starfssvið: stoðþjónusta innan stofnunarinnar. Bókasafn, búsýsla, öll fjármál og bókhald, starfsmannahald, tölvumál, búrekstur og rekstur fasteigna og bifreiða.
- Skrifstofa
- Bókasafn
- Búsýsla
- Öryggisþjónusta
-----
Bakteríu- sníkjudýra- og meinafræðideild
Deildarstjóri er Vala Friðriksdóttir, valaf@hi.is
Starfssvið, grunn- og þjónusturannsóknir:
- Meinafræði
- Sníkjudýrafræði
- Sýklafræði
- Bóluefnaframleiðsla, önnur framleiðsla
- Fagleg umsjón með búsýslu
- Tilraunadýrahald
-----
Deildarstjóri er Árni Kristmundsson, arnik@hi.is
Starfssvið, grunn- og þjónusturannsóknir:
- Fiskaónæmisfræði
- Fisksjúkdómar
- Heilbrigðiseftirlit fiska
-----
Veiru- og sameindalíffræðideild
Deildarstjóri er Sigurbjörg Þorsteinsdóttir, sibbath@hi.is
Starfssvið, grunn- og þjónusturannsóknir:
- Ónæmisfræði
- Sameindalíffræði
- Veirufræði